UC San Diego researchers created coralME, a tool that quickly models gut microbes, revealing how diet affects gut health and linking microbial changes to inflammatory bowel disease. Los investigadores de UC San Diego crearon coralME, una herramienta que modela rápidamente los microbios intestinales, revelando cómo la dieta afecta la salud intestinal y vinculando los cambios microbianos a la enfermedad inflamatoria intestinal.

Researchers at UC San Diego have developed coralME, a new tool that rapidly creates detailed metabolic models of gut microbes, enabling scientists to predict how these organisms respond to nutrients and diets. Los investigadores de UC San Diego han desarrollado coralME, una nueva herramienta que crea rápidamente modelos metabólicos detallados de microbios intestinales, lo que permite a los científicos predecir cómo responden estos organismos a los nutrientes y las dietas. The tool generated 495 models of common gut bacteria in a fraction of the time manual methods would take, revealing that low-iron or low-zinc diets may favor harmful microbes, while certain macronutrients support beneficial ones. La herramienta generó 495 modelos de bacterias intestinales comunes en una fracción del tiempo que tomarían los métodos manuales, revelando que las dietas bajas en hierro o zinc pueden favorecer a los microbios dañinos, mientras que ciertos macronutrientes apoyan a los beneficiosos. Applied to inflammatory bowel disease (IBD) data, coralME identified shifts in gut chemistry—such as higher pH and lower protective short-chain fatty acids—and linked specific microbial changes to the disease. Aplicado a los datos de la enfermedad inflamatoria intestinal (EII), el coralME identificó cambios en la química intestinal, como un pH más alto y un menor nivel de ácidos grasos de cadena corta protectores, y relacionó cambios microbianos específicos con la enfermedad. The findings could improve diagnosis and personalized treatment for IBD and other microbiome-related conditions. Los hallazgos podrían mejorar el diagnóstico y el tratamiento personalizado para la EII y otras enfermedades relacionadas con el microbioma. The study was published on November 20, 2025, in Cell Systems. El estudio fue publicado el 20 de noviembre de 2025, en Cell Systems.